Основой любой технологии выявления ГМО является использование различий между немодифицированными сортами и трансгенными растениями. Это может быть осуществлено путем детекции новой ДНК, которая была введена, либо экспрессированного нового белка, либо использованием химического анализа для выявления продукта ферментативной реакции.

Существует два научных подхода, широко используемые в настоящее время для выявления генетических модификаций в сельскохозяйственных культурах, таких как соя, кукуруза, хлопок и ряд других. Один из подходов – иммуноферментный метод ELISA (Enzyme-Linked ImmunoSorbent Assay), включает тестирование на присутствие специфических белков, с использованием специфического связывания между экспрессированным антигеном и антителом; другой подход – ПЦР (PCR – Polymerase Chain Reaction) - основан на детекции последовательностей ДНК, введенных в данное культурное растение. Эти методы показывают отсутствие или наличие ГМО в образце, но могут дать и некоторые указания на количество (процентное содержание) ГМО в исследуемом образце.

Первый метод, утвержденный на уровне ЕС, - это основанный на ПЦР метод скрининга, способный выявлять большинство ГМО, разрешенных для продажи в настоящее время.

Фирма "АЛСИ" предлагает полный набор оборудования для определения ГМО в сельскохозяйственных культурах методом ПЦР: амплификаторы (в том числе ПЦР в реальном времени), центрифуги, дозаторы и лабораторный пластик компании EPPENDORF, ламинарные шкафы, боксы биологической безопасности и ПЦР-боксы компании ESCO, весы компании METTLER TOLEDO, оборудование для электрофореза компании SIGMA, стандартные образцы, реактивы и т.д.