Госэкоинспекция является центральным органом исполнительной власти, деятельность которого направляется и координируется Кабмином через Министра экологии и природных ресурсов, реализующим государственную политику по осуществлению госнадзора в сфере охраны окружающей природной среды, рационального использования, воспроизведения и охраны природных ресурсов.