Факультет військової підготовки Національного університету державної податкової служби України готує офіцерів запасу в обсязі, який визначається замовленнями на їх підготовку з числа студентів Національного університету державної податкової служби України. Підготовка відбувається за кошти фізичних та юридичних осіб за встановленими Міністерством оборони України військово-обліковими спеціальностями:
     “Бойове застосування механізованих з’єднань, військових частин і підрозділів”, ВОС - 021000; “Фінансове забезпечення і економіка бойової та господарчої діяльності військ (сил)”, ВОС - 310101; “Юрисконсультська робота”, ВОС - 850300.
     Військову підготовку проходять громадяни України, придатні до військової служби за станом здоров’я та морально-діловими якостями, якщо їм на початок військової підготовки не виповнилось 25 років.
     Зарахування студентів на факультет військової підготовки Національного університету державної податкової служби України проводиться за результатами конкурсного відбору, який включає: оцінку рівня успішності навчання студентів; професійно-психологічний відбір; оцінку рівня успішності та засвоєння студентами програми допризовної підготовки; оцінку рівня фізичної підготовки студентів.
     Військова підготовка студентів за програмою офіцерів запасу у Національному університеті ДПС України організовується та проводиться відповідно до вимог Закону України “Про вищу освіту”, “Положення про військову підготовку студентів вищих навчальних закладів за програмою офіцерів запасу “(Постанова Кабінету Міністрів України від 26.07. 2001 року № 866), “ Положення про військові навчальні підрозділи вищих навчальних закладів” (Наказ Міністерства освіти і науки України і Міністерства оборони України від 20.06.2003 року № 400/192).
     Навчальні заняття в основному проводяться у спеціалізованих аудиторіях, що підвищує їх ефективність.
Практичні навички студенти  набувають під час проведення групових, практичних занять, тренувань, а також навчального збору, який щорічно проводиться в 169 навчальному центрі смт. Десна, де студенти практично відпрацьовують всі нормативи з тактичної та вогневої підготовки, виконують вправи стрільб з усіх видів стрілецької зброї, передбачених програмою. Практично відпрацьовують нормативи з експлуатації бронетанкової техніки та навички водіння БМП. Після проходження навчального збору студенти складають Військову присягу на вірність Українському народові.
     Завершальним етапом навчання з метою встановлення фактичної відповідності рівня підготовки випускників вимогам кваліфікаційних характеристик є випускні іспити.